Оснащена новым 24,2-мегапиксельным CMOS-сенсором, который подходит как для фото-, так и для видеосъемки, хорошо работает в условиях низкой освещенности и обеспечивает яркие и точные цвета. Позаимствованный у R3, процессор DIGIC X позволяет Canon EOS R6 Mark II соответствовать мультимедийному направлению камеры. Способный обрабатывать высокоскоростные серийные съемки, а также видео высокого разрешения 4K, DIGIC X поддерживает непрерывную съемку со скоростью до 40 кадров в секунду с бесшумным электронным затвором или 12 кадров в секунду с механическим затвором, с полностью рабочим автофокусом и замером экспозиции. Кроме того, обновленные алгоритмы обработки способствуют улучшению картинки при слабом освещении: диапазон чувствительности теперь расширяется от ISO 100 до 102 400 и может быть расширен до ISO 204 800 для работы в очень сложных условиях освещения.